最普通的植物化石类型是压印化石 。 覆盖的沉积物在植物碎片上由于重力作用而向下压 ， 就形成了压印化石 。 压印化石又可以分成两种：植物在这种压实作用下扁化成一层很薄的碳膜 ， 如果这层膜保存下来 ， 这种化石就称为压型化石；如果它没能保存下来 ， 就形成印痕化石 。 压印化石保存了植物碎片的形状和表面细节 。
【化石|植物化石：从煤炭到宝石】如果在强大的压实作用发生之前 ， 植物碎片周围的沉积物变得硬化 ， 就可能保存下来碎片的三维信息 。
在温泉中我们就可以看到这样的过程 。 落入泉水中的树叶、茎干等在腐烂之前就被水中的碳酸钙包裹起来 ， 形成清晰的“模子”（印痕）；后来 ， 植物体本身腐烂分解了 ， 但在碳酸钙沉积中却留下了空腔；再后来 ， 空腔被其他沉淀物填充 ， 就又形成了和植物体一模一样的“铸型” 。 形成印痕和铸件的这种保存形式 ， 不仅可以通过碳酸钙沉积这种方式 ， 还可以由其他富集的矿物（如菱铁矿）来完成 。 这类化石被认为是植物自身矿化作用形成的 ，
植物茎干的中央空腔可以形成另一类铸型化石 。 茎干落入水中 ， 在周围组织腐烂以前 ， 它的中央空腔被沉积物填充 ， 周围组织腐烂后 ， 就保留了内部沉积物的铸型 ， 这种化石称为“髓核” 。 比如茎部中空的芦木就非常容易形成这种化石 。
除了一般的石化木材 ， 还有两种比较罕见的：蛋白石化木材 ， 以蛋白石矿物为主；玛瑙石化木材 ， 以玛瑙矿物为主 。
当石化木材中的浸润填充质为结晶致密细腻的玉髓质时 ， 后期再被含铁的矿物溶液浸染 ， 便会呈现迷人的红色 ， 类似玛瑙 。 这种石化木材有着玉石般的质地和色泽 ， 如果不是有的地方还能辨认出年轮和细胞的结构 ， 人们很难将它同植物联系起来 。
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