谷歌自动重建果蝇完整大脑,40万亿像素图像首度公开( 七 )

谷歌自动重建果蝇完整大脑,40万亿像素图像首度公开

不规则截面的替换

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整体FAFB-FFN1的分割pipeline

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Segmentation-assisted神经元跟踪

果蝇大脑与Neuroglancer的交互可视化

当处理包含数万亿像素和形状复杂的物体的3D图像时,可视化既重要又困难。受谷歌开发新可视化技术的历史启发,研究人员设计了一种可扩展且功能强大的新工具,任何拥有支持WebGL的网页浏览器的人都可以访问。

结果就是Neuroglancer,一个在github上的开源项目,可以查看petabyte级3D volume,并支持许多高级功能,如任意轴横截面重构(arbitrary-axis cross-sectional reslicing),多分辨率网格,以及通过与Python集成开发自定义分析workflow的强大功能。该工具已被合作者广泛使用,包括艾伦脑科学研究所、哈佛大学、HHMI、马克斯普朗克研究所(Max Planck Institute)、MIT、普林斯顿大学等。

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