一般来说 ， 像骨骼这种身体重要部分应该被保护起来 ， 怎么能长到身体外面呢？就好像心脏不长在胸腔里 ， 反而长在了身体外面 ， 能活下去吗？乌龟的这种情况 ， 显然是违背了生物生存繁衍的常识 ， 科学家也对此困惑不解 ， 希望从那些古老的化石中找到答案 。 从达尔文进化论学说出发 ， 生物形态的演变是与环境分不开的 ， 也就是说定然是由于环境的因素导致乌龟的先祖选择了这种不可思议的进化方式 。
最初科学家猜测 ， 乌龟有甲壳是为了防御 ， 防止那些猎捕者伤害到自己 ， 但是这个推测显然有些站不住脚 ， 因为乌龟付出了速度的代价 ， 行动缓慢死的不是更快了吗？就在这个时候 ， 古生物化石方面却有了新的进展 。
化石发现
在1887年 ， 人类发现了一种奇特的化石 ， 经过鉴定 ， 这是2亿多年前的乌龟化石 ， 科学家将其命名为原颚龟 。
由于原颚龟长着和现在乌龟一样的龟壳 ， 因此被认为是现在乌龟的祖先 。 这个发现让科学家确定了一件事情 ， 乌龟在更久远之前就有了龟壳 ， 于是就将目光放在了锯齿龙的身上 。 锯齿龙生活在2.9亿年前 ， 比原颚龟更古早一点 ， 它的行走方式与乌龟类似 ， 并且背部也有叠甲 ， 科学家认为是原颚龟是从锯齿龙演变而成的 。
但是这个结论也没活多久 ， 2008年 ， 我国贵州出现了另外一种乌龟化石——半甲齿龟 ， 比原颚龟早出现1000万年左右 ， 而外形看上去像是进化了一半的乌龟 。 更让科学家惊讶的是 ， 它的龟壳长在腹部 。 科学家只能放弃原先的想法 ， 认为半甲齿龟演化出了原颚龟 。
很快又发现了更古老的乌龟化石——正南龟 。 正南龟生活在距今2.8亿年前左右 ， 比半甲齿龟更加古老 ， 它还没有演化出龟壳 ， 随后在德国发现一个名为祖龟的化石 ， 其存在年代比正南龟晚 ， 而且腹部有演化成腹甲的趋势 。 于是一条演化链被科学家提出来 ， 由正南龟演化成祖龟 ， 随后变成了半甲齿龟 ， 再到原颚龟 ， 最后是今天的乌龟 ， 仿佛这就是最终答案了 。
然而分子生物学的最新发现直接推翻了这个结论 ， 通过对所有爬行动物的基因图谱进行分析对比 ， 分子生物学者指出：乌龟和鸟类、鳄鱼具有十分亲近的血缘关系 ， 他们应该有共同的祖先——一种双孔类爬行生物 ， 而正南龟则是一种无孔类生物 。 在遥远的2.8亿年前 ， 也就是正南龟生活的时代 ， 这三类动物还没分开进行演化 ， 也就是说 ， 在那个时候 ， 乌龟真正的祖先应该是具备鸟类和鳄鱼的特征 ， 这就跟正南龟的存在冲突了起来 ， 科学家只能推翻原先的假设 。
就在科学家在为2.8亿年前 ， 乌龟的先祖到底是什么样争论不休的时候 ， 中国境内又出现了新的乌龟化石——始喙龟 ， 其生活年代是在2.28亿年前 ， 也就是祖龟和半甲齿龟中间的那段时间 ， 神奇的是 ， 它没有龟甲 。 无论是半甲齿龟还是祖龟 ， 祖龟要演化成龟甲 ， 演化到一半又演化回去变成了始喙龟？最后又演化出腹部龟壳成了半甲齿龟？
新的假设
科学家依旧对乌龟的祖先乐此不疲地研究着 ， 希望能找到一条正确的演化线路 ， 最新的一个说法是趋同演化假设 ， 这种说法得到了生物学界科学家的普遍认可 。
趋同演化的意思是指生物在演化过程中 ， 虽然没有亲近的血缘关系 ， 但是由于所处的环境相似 ， 有着差不多的进化压力 ， 那么截然不同的生物也会演变出来近似的特征 。 科学家认为 ， 虽然在2.8亿年前 ， 乌龟的祖先应该有着鳄鱼和鸟类的特征 ， 不应该正南龟那样的 ， 但是在趋同演化的理论下 ， 这个还是可以解释的 。 乌龟的先祖为了能够适应环境 ， 在同一时期内出现不同的样子是能理解的 。
那么这个假说真的就是最后的答案了吗？可能未来随着新的乌龟化石被发现 ， 我们还会提出新的假说 ， 又或者证明这个假说是正确的 。
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