【大门|陈根:特异性疗法,打开精准治疗大门】
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文|陈根
尽管癌症的诊断和治疗已经取得了一定程度的进步 , 但在很多国家 , 癌症仍然是导致儿童死亡的一大元凶 。 由于儿童时期癌症发病年龄和肿瘤生物学特性不一致 , 使得不同儿童期癌症具有病理学和临床表现上的异质性 。
然而 , 个性化儿童癌症的治疗面临着挑战 , 仅45%的儿童癌症与成人癌症有着相同的驱动基因 , 因此儿童癌症需要新的治疗药物 。 此外 , 儿童癌症通常是由结构性变异驱动的(SVs) , 这些变异难以识别和靶向 。
在精准医疗的指导下 , 新的靶向疗法和免疫疗法发挥出巨大的潜力 。 依据肿瘤分子特征的变化来制定个性化疗法 , 可以更有效地控制癌症 , 并减少治疗带来的副作用 。
近日 , 来自圣裘德儿童研究医院的研究人员利用较为全面的测序方法 , 对309例儿童癌症患者做了全基因组测序(WGS)、全外显子测序(WES)、RNA-seq研究 , 发现86%的患者都携带与诊断(53%)、预后(57%)、治疗(25%) , 以及癌症易感性(18%)相关的变异 。
通过对比肿瘤细胞与生殖细胞系WGS和WES的数据 , 研究人员发现在单核苷酸变异(SNV)和插入删除变异(indels)中有41%变异频率低于0.2 , 15%低于0.1 。 这表明使用该测序方法能发现许多致病或可能致病(P/LP)的变异 。
此外 , 研究团队利用WGS数据寻找SVs , 在90例患者中发现了34组不同的驱动基因融合 , 其中有30组是有着明确或者潜在的诊断、预后、治疗应用价值的 , 有23组是不同癌症的诊断信号 。
接着 , 研究人员利用来自FDA的治疗靶点数据 , 以及其他的基于NGS的研究成果和专业的指南 , 发现在253例患者中有218例(86%)都至少携带一个与诊断、预后、治疗 , 以及癌症易感性相关的变异 。
在G4K研究中 , 有78例患者患有复发或转移性癌症 , 而且并没有合适的临床试验可供他们参与 。 但其中的12例患者在接受了与他们的肿瘤突变特征相匹配的靶向药治疗后 , 有5例出现了缓解 。 这表明全面的基因组和转录组分析促进了儿童癌症的精准医疗 。
该研究结合利用了WGS、WES、RNA-seq三种不同的测序数据 , 全面描述了儿童癌症的基因组特征 。 未来可靶向药物治疗肿瘤变异 , 为儿童癌症精准治疗提供道路 。
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