乙醇|知识分享:动物细胞基因组DNA提取


乙醇|知识分享:动物细胞基因组DNA提取
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实验原理
真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内 , 制备DNA将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离 , 同时保持DNA分子的完整 。 提取DNA的过程是指将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质 , 再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质 , 得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出 。 蛋白酶K的重要特性是能在SDS和EDTA(乙二胺四乙酸二钠)存在下保持很高的活性 。
在提取DNA的反应体系中 , SDS用于细胞膜、核膜 , 并使组织蛋白与DNA分离 , EDTA则抑制细胞中Dnase活性;而蛋白酶K可将蛋白质降解成小肽或氨基酸 , 使起与DNA分子分离开来 。
实验材料
(1)细胞裂解缓冲液:
Tris (pH8.0) 100 mmol/L ;EDTA (pH 8.0) 500 mmol/L; NaCL 20 mmol/L; SDS 10% ;胰RNA酶 20ug/ml 。
(2)蛋白酶K: 称取20mg蛋白酶k溶于1ml灭菌的双蒸水中 , 用一次性过滤器过滤除菌 , -20℃备用 。
(3)TE缓冲液(pH 8.0) , 高压灭菌后室温贮存 。
(4)酚:氯仿:异戊醇=25:24:1(体积比) 。
(5)NaAc 3 mol/L 。
(6)异丙醇、冷无水乙醇、70%乙醇、灭菌水 。
实验过程
1、取新鲜或冰冻动物组织块0.1g(0.5cm3) , 尽量剪碎 。 放入匀浆器中 , 加入2ml细胞裂解缓冲液 , 然后充分研磨 , 至不见明显组织块 , 然后转入1.5ml 离心管中 , 以12000 rpm离心5min 。
2、弃掉上清 , 加入0.4ml细胞裂解缓冲液 , 迅速吹散沉淀 。 加入20ul蛋白酶K(0.2mg/ml) , 混匀 。 在65℃恒温水浴锅中水浴30min , 或转入37℃水浴12~24h , 间歇振荡离心管数次 。 于台式离心机以12000 rpm离心5min , 取上清液入另一离心管中 。
3、加入等体积酚:氯仿:异戊醇抽提一次 , 温柔混匀 。 4℃条件下 , 10000rpm , 离心10min 。
4、轻轻吸取上层液面 , 注意不要吸到两层之间的白色沉淀 。 如上层液面中白色沉淀较多或浑浊可以再次加入等体积酚:氯仿:异戊醇抽提一次 。
5、向吸取的上清液中加入1/10体积的NaAc , 轻柔混匀 , 然后加入2.5倍体积的-20℃预冷的无水乙醇 , 轻柔混匀后 , -20℃冰箱中沉淀过夜 。
6、12 000rpm 离心 20min , 弃上清;加入-20℃预冷的75%乙醇 , 12000rpm 离心 15min 室握温干燥 , 加入适量无菌水溶解基因组DNA , 存放于 4℃ , 如溶解不充分可轻摇溶解过夜 。
注意事项
1、选取的组织须是新鲜材料 , 且处理时间不宜过长 。
2、操作过程尽可能在低温条件进行 , 避免基因组DNA降解或断裂 。
3、使用酚:氯仿:异戊醇 , 乙醇抽提或沉淀DNA时须轻柔操作 , 避免DNA降解或断裂 。
4、实验中会使用到有机试剂 , 须注意防护 , 并在通风条件下进行操作 。
常见问题及分析

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