基因编辑明星动物遇挫:无角牛体内发现细菌基因污染( 二 )

质粒 DNA 污染的发现

这是基因编辑操作过程导致的 DNA 污染。

7 月 28 日,美国 FDA 的科学家 Alexis L. Norris 和 Stella S. Lee 在预印本 bioRxiv 发表题为《在基因组编辑种系牛中发现质粒模板》一文。研究人员分析了来自该牛的全基因组测序数据,在靶位点发现了质粒和第二个修复模板 DNA 序列的杂交整合。

FDA 研究人员发现,两头基因编辑牛中都存在全长的质粒骨架。在两头牛中,虽然一个等位基因产生了预期的编辑结果,但另一个等位基因的靶位点处发现质粒与修复模板序列的重组。

基因编辑明星动物遇挫:无角牛体内发现细菌基因污染

图2/3

图 | 修复模板和质粒整合在牛基因编辑的靶位点。图 a 为模板质粒,图 b 为未经编辑的亲本细胞系,图 c 为编辑过的牛基因结构。(来源:bioRxiv)

论文称,此前科学研究发现过哺乳动物基因编辑实验中靶点处出现了复杂的基因组重排现象,而这种现象通过常规的 PCR 和 DNA 测序方法难以检测出来。

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