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从生物遗传学的角度看 ， 非近亲繁殖能最大程度保持物种的基因多样性 ， 最终具有优势的后代会占据主导 ， 有利于物种的演化；而在近亲繁殖中 ， 虽然有利于特有基因的延续 ， 但劣势基因也不容易被消除 ， 不利于物种的演化 。
近亲繁殖的缺点
我们知道 ， 人类近亲结婚的话 ， 生育的后代有较大可能存在先天性缺陷疾病 ， 所以国家是禁止近亲结婚的；其实对于地球上的其他生物 ， 近亲繁殖也会存在同样的问题 ， 比如有研究表明 ， 大山雀近亲繁殖的后代 ， 死亡率比非近亲繁殖高了7% ， 家猪近亲繁殖的后代体质较弱 ， 生长也比较缓慢 。
【近亲繁殖有什么优缺点？有哪些近亲繁殖的例子？】我们从基因重组的角度很容易解释其中的原因 ， 地球生物经过上百万年的演化 ， 每个物种的基因都有一定的复杂程度 ， 比如人类有2~3万个基因 ， 狗有2万个基因 ， 水稻有近4万个基因 ， 小麦有10多万个基因 。
以人类来说 ， 就是这2万多个基因 ， 精确描述了人类“画像” ， 每个基因控制一个或者多个性状 ， 比如决定你是单眼皮还是双眼皮、左撇子还是右撇子、黄皮肤还是白皮肤、以及血型等等性状 。
但其中一些基因对人类来说是不利的 ， 比如会造成红绿色盲症、镰刀型贫血症、血友病等等 ， 在这些遗传性疾病当中 ， 绝大部分属于隐性遗传 ， 有一个表达为正常的显性基因压制着 ， 如果是近亲结婚 ， 这些隐性基因被表达的概率大大增加 ， 导致后代存在先天性缺陷疾病 。
如果是非近亲结婚 ， 由于人类基因的多样性 ， 两个非近亲的人同时携带一种隐性遗传病基因的概率大大降低 ， 有效避免了遗传病的表达 ， 而且基因相差较大的两个个体 ， 后代基因重组的多样性大大增加 ， 有利于该物种的进化 ， 种群对环境的适应能力也大大增强 。
近亲繁殖的优点
当然 ， 近亲繁殖也是存在优点的 ， 能最大程度保留自身的特有基因 ， 比如一些数量较少但是外型好看的宠物（狗、猫、猪等等） ， 如果和其他品种的宠物进行杂交 ， 后代就会失去原有宠物的外形特性 ， 有时候只能进行近亲繁殖 ， 来保持后代的一致性 。
对于一个物种而言 ， 近亲繁殖的特点是优者越优 ， 劣者更劣 ， 总的来说是缺点大于优点 ， 尤其是对动物来说特别明显 ， 所以绝大部分高等动物最终都选择了两性繁殖来避免近亲生育 。
生物实例
在以前 ， 欧洲的皇室家族为了保持自身家族的纯正 ， 皇室之间的通婚非常频繁 ， 导致很多因为近亲结婚遗留下来的家族遗传病 ， 血友病就是其一 ， 患有血友病的人 ， 表现为血液中的凝血酶不足 ， 一旦出现外伤就会流血不止 ， 甚至有时候一个小伤口就会导致失血过多 。
大名鼎鼎的维多利亚女王就是血友病的携带者 ， 而且维多利亚女王还是近亲结婚（嫁给了比她小三个月的表弟） ， 导致她的三个子女也患有血友病 ， 最终血友病在欧洲皇室中蔓延开来 ， 很多皇室家族成员都死于血友病 。
科莫多巨蜥生活在印尼以及南非的少数岛屿上 ， 数量只有3000多只 ， 由于地理隔离的原因 ， 科莫多巨蜥经常需要进行近亲繁殖 。
甚至在极端的情况下 ， 雌性科莫多巨蜥的卵细胞可以发生分化 ， 进而代替精细胞 ， 与卵细胞结合为受精卵 ， 实现孤雌生殖 ， 孤雌生殖相对于近亲繁殖来说多样性降到了最低 ， 但相对于自身物种灭绝的危险来说 ， 这也是不得以的办法 。
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