Science|180种动物肠道菌群测序结果哪些信息值得关注( 二 )
本文插图
新发现的食腐肉的欧亚兀鹫（Gyps fulvus）的肠道细菌中的毒素代谢蛋白酶可能在抵抗食物中毒方面有应用 。
这项研究仅仅触及了可以用这个数据集检验的假设的表面 。 未来方向包括：
01 微生物群如何帮助动物降解有毒的植物化学物质 。
02 抵御食物中的病原体 。
03 从多种食物来源中提取营养的问题 。
四 ， 丰富了许多未知物种的细菌门 ， 并发现某些细菌进化枝相对于同一门中的其他细菌具有独特的功能特性 。 动物种类和已发现的动物种类（共存细菌的特定簇）之间的细菌状况有所不同 。 动物中这种未被探索的微生物多样性与被充分研究的人类微生物组形成了对比 ， 而人类微生物组在参考数据库中表现得更好 。 未描述的物种中的富集度最高的是疣状菌属（Verrucomicrobia） ， 这是一个存在于水、土壤和人类肠道中的门 ， 但培养物种相对较少 。
确定了多种途径和直系同源物 ， 这些途径和直系同源物在特定的动物性状中显着丰富 ， 并表明功能性景观与这些性状相关 。 这些功能中的一些功能提示了野生生物微生物群的新角色和特性 。 绘制野生动物的微生物群落图也可能有助于野生微生物的保护工作 。
五 ， 重述了首次通过扩增子测序发现的结果 ， 包括食草动物微生物组比食肉动物微生物组更加多样化 。 这是一个比较重要的发现 ， 是否说明植物性饮食可以提高微生物多样性？此外 ， 不同动物群体的微生物组编码的遗传途径因宿主饮食、体型和其他特征而不同 。
六 ， 野生动物的微生物区系也是动物和人类病原体的天然库 ， 如当前的COVID-19大流行一样 ， 通过对野生生物微生物景观的广泛的基因组集合可以阐明其传播到人群中的时间和途径 。
该研究值得注意的问题：
一 ， 使用MAGs（宏基因组组装的基因组）限制了研究其中一些目标的拓展 ， 即保护医学和生态上重要的细菌菌株 。 有些微生物物种将需要分析未组装的读取、培养或富集技术 ， 而不是本研究中使用的全基因组测序 。
二 ， 即使是那些基因组被MAG组装捕获的细菌 ， 这些组装体也倾向于排除“辅助”基因组 ， 即在不同菌株间存在的基因 。 然而 ， 这些基因往往在适应特定的宿主和环境中发挥作用 。 例如 ， 抗菌素抗性、致病性和能量收集是经常由移动元件或其他辅助基因编码的性状 。
三 ， Levin等人检测到的大多数非特征微生物在宿主体内的活动 ， 以及它们是稳定地定殖在动物体内还是短暂地通过它们的胃肠道的问题仍然存在 。 在这个庞大的数据集上测试每个假设需要大量的计算、解释和实验验证 。
参考文献：
Levin D, Raab N, Pinto Y, et al. Diversity and functional landscapes in the microbiota of animals in the wild[J]. Science, 2021, 372(6539).
Coleman M. Diagnosing nutritional stress in the oceans[J]. Science, 2021, 372(6539): 239-240.
L.-X. Chen, K. Anantharaman, A. Shaiber, A. M. Eren, J. F. Banfield, Genome Res. 30, 315 (2020)
E. C. Lindsay, N. B. Metcalfe, M. S. Llewellyn, J. Anim.Ecol. 89, 2415 (2020)
【Science|180种动物肠道菌群测序结果哪些信息值得关注】本文转载自其他网站 ， 不代表健康界观点和立场 。 如有内容和图片的著作权异议 ， 请及时联系我们（邮箱：guikequan@hmkx.cn）
推荐阅读
- 喜欢虐待小动物的孩子有心理障碍
- 吃肉导致癌症排泄不良
- 动物内脏爆炒吃法不安全
- 牙齿不好是因为有这习惯
- 解析肝脏都是毒 吃了就中毒
- 什么动物的肉有毒 这5种肉再香也不能吃
- 晚育能不能延缓女性衰老
- 轻微肾衰竭的早期症状
- 初乳是什么样的
- 肝脏大是怎么回事呢