人工智能还能这样玩？DNA测序时间大幅缩短 _UFO

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【人工智能还能这样玩？DNA测序时间大幅缩短】

加快基因组测序过程为该项目赢得了吉尼斯世界纪录的称号。斯坦福大学领导的一个研究小组创造了新的吉尼斯世界纪录，即使用人工智能计算来加快工作流程速度的最快DNA测序技术。

该研究由斯坦福大学医学院医学，遗传学和生物医学数据科学教授Euan Ashley博士领导，与Nvidia ， Oxford Nanopore Technologies ， Google ， Baylor College of Medicine和加州大学合作，在短短五小时两分钟内实现了测序。
该研究发表在《新英格兰医学杂志》（The New England Journal of Medicine）上，涉及依靠新技术加快基因组测序工作流程的每一步。这包括在Oxford Nanopore的PromethION Flow Cells上使用纳米孔测序，每小时生成超过100千兆字节的数据，并在Google Cloud上使用Nvidia GPU来加快基本呼叫和变体呼叫过程。
\"我们不得不彻底重新思考和改造我们的数据管道和存储系统， \"Ashley 说。

研究人员还依靠Nvidia Clara Parabricks计算基因组学应用框架来加速基因组诊断。\"这只是那些令人惊叹的时刻之一，合适的人突然聚集在一起，取得了惊人的成就， \"阿什利说。 \"真的感觉我们正在接近一个新的领域。
在这项研究中，该团队在斯坦福医院重症监护室的未确诊患者身上测试了加速基因组测序技术。共有12名患者入组并进行了基因组测序。在总数中，有五名患者的基因诊断迅速得到回报。在其中一个案例中，只花了五小时两分钟。
研究人员认为，减少DNA测序时间意味着临床医生可以更快地诊断患者并提供量身定制的治疗方法。之前的DNA测序吉尼斯世界纪录是由Rady儿童研究所保持的14小时。
该团队现在正在寻求进一步减少时间，相信它可以再次减半。

\"我认为我们可以再次将其减半， \"阿什利说。 \"如果我们能够做到这一点，我们谈论的是能够在医院病房巡视结束之前得到答案。这是一个戏剧性的飞跃。

人工智能还能这样玩？DNA测序时间大幅缩短

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