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到了20世纪早期 ， 科学家进一步证实了天花、结核病、和疟疾、黄热病等疾病和病原体微生物 ， 有着密切的关系；
这一系列的发现结果 ， 和斯图尔德的母亲所信服的完全不同 。
童年的斯图尔德总处在困惑的迷雾里 ， 到底是相信老师所讲的 ， 还是相信母亲所说的 ， 这使得斯图尔德童年的内心 ， 充满了矛盾和疑惑 。
同时 ， 在一次实验课上 ， 斯图尔德借助显微镜看到了细菌 ， 但他不像其他同学那样兴奋 ， 而是陷入了更加两难的情境 。
他仍不知道应该相信他自己所看到的 ， 还是应该继续相信母亲告诉他的那句箴言——世界上不存在什么细菌或微生物 。
斯图尔德的母亲 ， 给童年的斯图尔德带来的不止是这些困惑 ， 还有他对斯图尔德生活照顾上的变化 。
自斯图尔德的母亲转向基督教科学派之后 ， 几乎将注意力都转到了宗教信仰 ， 而基督教科学派对于疾病的治疗 ， 则提倡精神治愈 。
因而当斯图尔德生病后 ， 其母亲便用祈祷的方式为其治疗 ， 但事实上并没有治愈好斯图尔德的身体 。
这使得童年的斯图尔德 ， 长久的遭遇病痛的折磨 ， 从小对疾病产生了巨大的恐惧 ， 对母亲的信仰也产生了抵触的情绪 。
斯图尔德像他父亲一样 ， 从来不会去教堂 ， 并将他的兴趣放在他母亲所否定的方面 。
斯图尔德热爱自然和科学 ， 总是将宗教教条和非理性相对等 ， 这和他母亲的思想也时常相冲突 。
在斯图尔德的童年生活中 ， 其父母婚姻关系的不和谐 ， 在一定程度上影响了他的成长 ， 使其总觉缺乏安全感 。
1895年格蕾丝?加雷特 ， 嫁给了比她大12岁的托马斯?斯图尔德 ， 但最终于1918年走向了离婚 ， 斯图尔德父母年龄的差距 ， 并不是最终离异的主要原因 。
其父母在离婚之前就已经出现了许多的隔阂 ， 托马斯?斯图尔德喜欢科学技术 ， 对物质的科学深信不疑 ， 喜欢机械类的发明 ， 这对斯图尔德产生了有益的影响；
而斯图尔德的母亲 ， 自从加入了基督教科学派之后 ， 极力地否认一些科学常识 ， 给斯图尔德带来了困扰 。
他们这样的差异 ， 走向分裂成了一条不可避免之路 。 其实斯图尔德父母这样的矛盾 ， 折射出了宗教和科学的较量 。
斯图尔德父母性格的差异也是其离婚的原因之一 ， 斯图尔德的父亲沉默寡言 ， 喜欢钻研机械的逻辑 ， 而他的母亲则能言善辩 ， 对基督教的信仰十分坚定 。
这看似互补的性格 ， 最终却走向了相反的结果 。 斯图尔德父母这样的关系 ， 给他的成长生活也带来了不少的烦恼 。
斯图尔德在父母离婚之前 ， 其父亲已退出了家庭好几年 ， 致使斯图尔德和其母亲经历了几年经济的拮据 ， 其经济的困难 ， 使得斯图尔德在后来人类学的研究中 ， 更加注重生存问题的研究 。
【宗教与科学的较量，成了幼年斯图尔德的困惑，他该何去何从？】同时也很在意自己的生存和收入问题 ， 这对他后来担当美国政府的专家证人 ， 也有着一定的影响 。
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