（3）枝梗鞭菌属枝梗鞭菌属是新美鞭菌门新美鞭菌科真菌的一属 ， 为到目前为止发现最晚的一属 ， 仅包含1种Cyllamyces aberensis 。 其学名来自威尔士语cylla（内脏）和古希腊语mykēs（真菌） ， 指本属最早发现于英国威尔士 ， 和新美鞭菌门其他属真菌一样为生活在食草动物消化道内的真菌 。 其特征是孢囊梗具分枝 ， 故中文名为“枝梗鞭菌属” 。 本属后来在印度也有报道 。
（4）新美鞭菌属新美鞭菌属是新美鞭菌门新美鞭菌科真菌的一属 。 其学名来自古希腊语词根neo-（新）、calli-（美丽）和mastix（鞭） 。 “新美鞭菌属”系台湾生物多样性资讯入口网所采用的中文名 。
（5）根囊鞭菌属根囊鞭菌属是新美鞭菌门新美鞭菌科真菌的一属 。 其学名中的-myces来自古希腊语词根mykēs（真菌） ， Orpino-系为纪念美国微生物学者C.G. Orpin ， 他是新美鞭菌门真菌的最早发现者 。 本属的特点是在根状菌丝体上产生孢子囊 ， 故中文名为“根囊鞭菌属” 。
（6）梨囊鞭菌属【中国创新|【地球生物全系列——真菌篇】真菌界—新美鞭菌门】梨囊鞭菌属是新美鞭菌门新美鞭菌科真菌的一属 。 其学名来自古希腊语词根pyro-（梨）和mykēs（真菌） ， 指其孢子囊为梨形 。
