在1741个神经元的数据集中“捕捉”到11种投射类型
为破解这些难题 , 东大脑智院与上海大学王宜敏博士团队开发了三维可视化Vaa3D-TeraVR平台 。 在VR模块中 , 研究人员可头戴VR设备 , “沉浸式观察”神经元结构 , 从而大大降低重建繁杂难辨的神经元的难度 。
同时 , 东大脑智院建立了自动化与手动结合的神经元重建流程 , 使神经元的形态“捕捉”变得更加高效、精准 , 并与安徽大学屈磊教授团队合作研发图像配准算法mBrainAligner 。 基于这些平台和算法 , 东大脑智院建立起完整的大数据管理和计算分析平台 。
“这些数据来自脑皮层、屏状核、纹状体和丘脑等脑区神经元 , 是目前世界上公布的最大单细胞脑神经元数据集 。 ”刘力娟说 。
【刘力娟|1741个!迄今最大的小鼠全脑神经元数据集建成】有了这些神经元的大数据 , 科研团队很快“捕捉”到其中11种主要的神经元投射类型 。
“其中 , 以往被认为可能是意识开关的屏状核与侧皮层属于同一转录组类别Car3 , 但是实际上它们的投射目的地却截然不同 。 屏状核的神经元平均投射区域可达20个 , 单个神经元间的投射目的地差异巨大 。 ”
更让团队欣喜的是 , 拥有同样的转录组信息的神经元 , 却呈现了多样的神经元形态 , 这说明神经信号被传送到不同的脑区域 。
“神经元形态的多样性 , 对于多水平地了解神经元功能、揭示神经元形成的复杂神经环路提供了直观的切入点 。 ”刘力娟解释 。
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