资本过热?名过其实?高通量测序在病原微生物临床应用的前景如何?( 八 )

问:可以送到你们那测吗?如果实验室在医院旁边,测序很方便,但是实验室在另一个地方,就无法做到了。

方圆:最主要的问题是 RNA 在三小时以内开始降解,运输过程中肯定会遇到很多问题。我的理解是,PCR 这一类的办法就能解决流感或者寨卡的 RNA 病毒,不一定非要用到 NGS。

覃俊杰:我认为测序应该在 RNA 病毒检测方面发挥很大的作用。病毒本身变异非常的快,用传统的 PCR 方法涉及引物特异性,不一定能准确鉴别。

之前一例成人脓毒血症的病例样本,我们检测发现是汉坦病毒引起的感染。测完之后,发现我们所检测到的这个病毒的基因组跟已知数据库中的病毒基因组相比,有一半都发生了变异。

通过传统方法无法对这类变异很大的病毒进行准确鉴别,所以我觉得测序在病毒检测方面的价值可能要比细菌更大。

怎么去检测不同种类的病毒,包括样本的制备、后面的分析可能都不一样。Illumina 和 Nanopore 已经在测序环节上做得很好了。

但是样品制备、后续分析会是我们这类专业微生物检测公司的技术壁垒,而且这个壁垒是要跟临床一起合作研究的,不同种类的病毒、不同类型的样本、不同的临床需求所采用的策略有可能都不一样。

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