资本过热?名过其实?高通量测序在病原微生物临床应用的前景如何?( 九 )
三代测序 Nanopore 是什么?
方圆:NGS 目前在时效上还有一些瓶颈,现在我们谈谈三代吧。目前是什么样的情况?跟二代的优势差异有哪些?目前临床上的应用是什么情况?
涂浩波:二代测序是把它打断成小的片段,边合成边测序,周期就比较长,完成了测序以后才能进行结果的分析和判读。
而三代测序——纳米孔测序(Nanopore)则是通过引导单分子链穿过纳米孔实时判读电流信号的变化,去读取碱基序列。
Nanopore 最主要的两个特点,一个是实时测序,一个是读长非常长。
读长如果长的话 ,对微生物的物种判定会有一定的优势。好比人脸识别,能看一张脸的一半和只能看见嘴巴上面的一根胡子,判读的难度是完全不一样的。所以基于 Nanopore 的应用开发能够提供更加干净的结果。
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