不过炼金术并未真的终止 ， 而是转到了暗处秘密进行 。 文艺复兴时期 ， 瑞士有个叫德奥弗拉斯特·冯·霍恩海姆的年轻人 ， 出身医师家庭自幼在矿场拜师学习炼金术 ， 认为崇古不如实践出真知 ， 靠着自己擅长的化学实验 ， 炼制了不少医疗药物 ， 成为医药化学理论的开创者 。 1543年 ， 在霍恩海姆死后两年 ， 哥白尼发表了他的《日心说》与行星系统论 ， 科学革命于焉登场 ， 人类的文明进程开始逐渐回归正确的道路 。
其实在很长一段时间里 ， 炼金术才是正统的“科学” ， 化学反而像是异端 ， 历史上很多科学家 ， 同时也是教徒 。 18世纪20年代 ， 巴黎皇家科学院将化学范围内最容易受到批判的事物分离出去 ， 贴上“炼金术”的标签 ， 而被认为有用的过程和观念则作为“化学”被保留下来 。
炼金术时代的终结 ， 并不意味着他们的失败或错误 。 炼金术的思想理论随着现代化学的发展而保留下来；人类对自身、世界、宇宙的探索的脚步永不停止 。 所谓朝闻道 ， 夕死可矣 。
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