人类癌症基因组重复扩展机制
本报讯 美国斯坦福大学Michael Snyder等研究人员揭示了人类癌症基因组中反复出现的重复扩展（rRE） 。 相关论文近日发表于《自然》 。
研究人员在29种癌症类型的2622个癌症基因组中确定了串联重复（TR）的扩展 。 在7种癌症类型中 ， 研究人员发现了160个rRE ， 其中大部分（155/160）是亚型特异的 。 研究人员发现rRE在基因组中的分布是不均匀的 ， 在候选顺式调控元件附近富集 ， 这表明其在基因调控中的潜在作用 。 研究人员在34%的肾细胞癌样本中检测到一个rRE ， 即GAA-重复扩增 ， 位于UGT2B7第一个内含子的调控元件附近 ， 并通过长读DNA测序进行了验证 。
此外 ， 在初步实验中 ， 研究人员用一种GAA靶向分子处理藏有这种rRE的细胞 ， 导致细胞增殖的剂量依赖性下降 。 研究表明 ， rRE可能是人类癌症遗传变异的一个重要但未开发的来源 。 研究人员提供了一个全面的图谱供进一步研究 。
据介绍 ， 单一重复性DNA序列的扩展可引起50多种疾病 。 然而 ， 除了神经系统和神经退行性疾病之外 ， 人们往往没有对rRE进行探讨 。 在一些癌症中 ， 突变会在TR的短链中积累 ， 然而 ， 较大的rRE在癌症中还没有被系统分析过 。 （柯讯）
【人类癌症基因组重复扩展机制】《医学科学报》 (2023-01-06 第10版 国际)
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