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A. 样品分布图;B. 所有古代样品和现代样品的主成份分析图;C. 网络结构图;D. 同时具有古代和现代的2个单倍型 。
【古代|研究揭示东亚家猪遗传历史:黄河流域是独立的家猪驯化中心】2021年12月11日 , 《遗传学报(英文版)》(Journal of Genetics and Genomics)以研究论文形式在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、中国社会科学院考古所和陕西省考古研究院共同主导完成的古代东亚家猪线粒体全基因组研究成果 。 研究获取了42例来自于黄河流域的中国古代猪线粒体基因组数据 , 发现有部分类型从新石器时代早期直到现在连续存在于中国家猪群体中;全新世以来 , 家猪群体具有2次快速的种群扩增现象 。 这些研究结果对理解东亚地区的家猪母系遗传历史具有重要意义 。
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A. 简化的系统进化关系树;B. 推测的野猪在东亚的扩散途径;C. 依据东亚家猪和野猪构建的系统进化关系树;D. 贝叶斯种群扩增曲线图 。
动物的成功驯化对人类社会发展具有里程碑式的意义 , 猪是最早被人类驯化的动物之一 , 在农业社会中发挥了重要作用 , 它也是研究动物驯化的重要“模式动物” 。 至少在1万到8千年前 , 家猪已在安那托尼亚地区和中国中原地区独立驯化 。 古DNA的研究已证实安那托尼亚的家猪在约8500年前随着新石时代早期的农业人口进入欧洲 , 但进入欧洲的家猪不断与欧洲本地野猪混合 , 导致欧洲现生的家猪仅保留0-4%的近东祖源成份 , 显示出几乎完全替代的情况 。 而前述研究发现 , 东亚的情况与欧洲完全不同 。
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东亚家猪可能的起源区域及黄河流域野猪被驯化后的群体扩散方向示意图 。
本次研究一共获取了42例中国黄河流域古代猪(来自于陕西:鱼化寨、杨官寨等;安徽:尉迟寺;河北:小里;青海:喇家遗址)高质量的线粒体基因组数据 , 时间跨度为约7500-2500年前 。 研究发现遗址中出土的部分中国古代猪(25% , 可追溯到新石器时代早期)与一些东亚现代的家猪类型一样 。 表明它们存在母系遗传的连续性 , 而且至少可以追溯到新石器时代早期 , 这一结果支持黄河流域作为一个主要的家猪独立驯化中心 。 还发现古代家猪和现生家猪的线粒体相似度很高 , 大多数东亚现代家猪分享较近的线粒体基因组类型 , 并且群体具有很小的遗传距离值 , 反映出东亚家猪可能来源于一个母系遗传多样性本来就低的祖源群体 , 也可能与家猪选育的过程有关系 。
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