遗传漂移在正式模型中早已为人所知 ， 在该领域进行了研究 ， 并用于进化重建：它不仅是必要的 ， 而且与进化有因果关系 。 然而 ， 关于漂移和选择的本体论存在激烈的哲学辩论 。 一个主要的分歧涉及数学模型的认知地位：假设漂移是数学模型的必要特征 ， 关于世界上存在一个被称为漂移的过程 ， 可以合理地推断出什么？统计解释将漂移和选择视为个体聚合的数学特征 。 另一种观点认为它们是因果物理过程 。 的概念证据例如 ， 作为在替代解释性假设之间进行选择的一种方式 ， 选择与漂移是哲学研究的另一个对象 。 一些哲学家认为科学家更有资格评估和权衡证据 。 其他人指出 ， 探索生物学的解释性限制取决于哲学 。 完成此类任务的一种幸运方法是基于贝叶斯主义的证据技术说明 。 贝叶斯定理属于概率论的数学 。 它基于先验概率 ， 即观察之前特定陈述的概率 ， 以及后验概率 ， 即根据观察结果的陈述概率 。
同源性解释解释了生物特征的特性或变异性、翅膀的形式或不同生物群的不同翅膀形状的范围 ， 例如 ， 通过引用祖先特征或器官 ， 以及影响后代的修饰因素那个祖传的器官 。 与生物学中的许多解释模式一样 ， 同源性解释是历史性的 。 哲学家将同调解释与类比解释进行了比较 ， 指出 ， 同源性解释更详细 ， 并更好地解释了观察到的差异 。 同源解释也可以变成强有力的历史解释 ， 而不是只引用祖先的初始条件的弱解释 。 例如 ， 当对目标字符发展的详细分子研究启发精确事件时 ， 就会发生这种情况 ， 这在历史路径上一定是至关重要的 。
对遗传和发育途径的研究还提供了层次分离的途径 ， 对于科学家来说 ， 这种分离将同源性解释与科学哲学的经典主题联系起来：多重可实现性和还原论. 当“一个生物组织水平的同源物是由较低组织水平的非同源发育因素引起的”时 ， 就会发生层次分离 。 例如 ， 沿着历史路径 ， 形态结构可以保持稳定 ， 而其潜在的发展模块发生变化 。 这是多重可实现性的生物学例子 ， 即一个层次的组织不能被简化为较低层次的一种 。 反过来 ， 这反驳了哲学家关于生物学中的还原论的观点 。 同源字符的历史应该可以简化为它们的物理基础的历史 ， 但是等级分离显示了解耦的历史和多重可实现性 。
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