一般来说 ， 通过杂交育种需要7~15年的时间才能拥有所需形状和特性的植物 ， 但基因组只需要几个月 ， 不过测试阶段可能需要几年 ， 但基因组更精确 ， 直接针对理想性状 ， 而在杂交育种中 ， 想要的和不想要的特性是相互结合的 。
目前 ， 在世界范围内 ， 基因组作物的研究已经大大加快了步伐 ， 从2011年申请专利仅仅只有几项 ， 到现在已经有2000项专利 。 包括我国、美国以及大型农业跨国公司都在大力投资该项技术 ， 预计到本世纪末 ， 该技术的市场体量庞大到惊人 。
不仅仅是抗旱水稻 ， 目前已经研究成功的是番茄作物的产量提高了79% ， 也有科研团队正在试图将大豆种在退化和盐渍化的土壤中 ， 也有研究减少水稻中甲烷排放量的 。 另外 ， 在肯尼亚 ， 科学家们正在开发一种他们称之为“智慧香蕉”的产品 ， 在他们的实验中 ， 他们成功激活了一个基因 ， 以预防性地开启植物自身的免疫系统 ， 以抵抗一种因干旱而变得活跃的病毒 。
但是 ， 并不是说基因组就比转基因技术安全 ， 它也是有风险的 。 因为当你进行基因组时 ， 你会改变一个基因组中数千个其它基因相互作用的基因 。 这是目前最具争议性的地方 ， 特别是有许多新的作物品种仍处于研究阶段 ， 可用的数据和风险评估非常少 。
一些反对基因组的专家列举了脱靶基因变化的案例 ， 或者删除了比预期更多的基因信息的案例 。 以油料作物而言 ， 植物的通讯系统早稻破坏 ， 这在自然界中可能会破坏其对害虫的天然防御能力并可能影响整个生态系统 。 同时 ， 反对者也认为 ， 粮食不安全的存在更多的是粮食的分配不均和食物浪费 ， 而并非生产的粮食不够吃 。
另外 ， 在世界上大多数国家 ， 转基因作物被要求必须贴上“转基因”标签 ， 但是关于转基因标签是否仍然适用于基因组 ， 目前仍然没有定论 ， 但是在越来越多的国家被广泛争论 。
尽管基因组的方法可能非常先进 ， 但传统育种仍然同样重要 ， 它们都无法弥补我们目前给生态系统带来的巨大负担 。 但它可能会在未来填补粮食缺口方面发挥作用 。
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