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在一篇名为“生物学哲学不是什么”的著名论文中 , 大卫·赫尔写道 , 生物学哲学的任何工作都不应跳过“所有复杂的进化关系、各种机制的困难、顽固的数据、丰富的支持证据” 。 同样 , 生物学哲学倾向于建立在对当前生物学的深入了解和理解之上 , 通过对哲学专业之外的许多领域保持非偶发性的熟悉 。 重要的是要记住 , 生命科学及其对象会发生变化和发展 。 一个基本的例子就是“生命”的定义 。 例如 , 关于生命起源的科学研究或对地外生命的寻找 , 对于这样一个主题的答案以及哲学问题 。 生命的起源被认为是共同血统之树的根的向后延伸 。
它从一些普遍的“祖先有机体”回归到更简单、最小的生命实体 , 可能被称为“原始生命系统” , 并且沿着多个维度进一步分解为非生命物质.一般来说 , 哲学家与生物学家一起解释生命的历史 , 例如 , 试图理解主要的进化转变 。 真核生物的共生和多细胞的出现是主要转变的例子 。 生命历史上的那几个瞬间可以被看作是出现了一个新的组织层次 。 今天 , 生命之树的想法正受到大规模转移和分支之间界限模糊的证据的挑战 。 生物学史是一部关于生命及其历史观的变化史 , 生物学哲学参与了这一过程 。
在生物学哲学作为一个学术领域存在的 50 年里 , 生命科学的扩展是爆炸性的. 气候变化、生物多样性丧失、新形式疾病以及我们社会对资源管理的需求等巨大的全球性问题促成了这种增长 。 生命科学 , 包括生物医学、生态学和微生物学领域 , 面临着与现代世界相关的挑战 , 不仅因为受到质疑或积极抓住发展大型研究项目和计划的机会 , 而且还通过促进发现和感知这些挑战 。 与此同时 , 生命科学也取得了令人难以置信的技术进步:DNA 测序和分子分析的成本更低、速度更快;允许分析数十亿个核苷酸以寻找最可能的系统发育和模拟蛋白质或复杂表型进化的计算方法;巨大的共享信息数据库 , 如基因组项目 , 特别是人类基因组和监测功能分子整体复合物的各种“组学”项目;最后 , 这些技术进步在创造新型生物或疾病检测和治疗中的应用 。 进入 21 世纪的几十年的一个平行现象是科学文献和访问的爆炸式增长和可用性 。
生物学哲学的后果是什么?该学科不仅应该在理解、描述和传播科学方面发挥作用 , 而且还应该在帮助科学计划的发展方面发挥作用 。 鉴于上述爆炸性的历史动态 , 几乎生物学的每个子领域都需要一个哲学家来深入研究其独特的概念、方法、对象和概念问题 。 因此 , 生物学哲学的一些介绍遵循逐个领域的标准 , 列举了诸如“生态学哲学”或“分子生物学哲学”之类的项目 。 这种多领域的展示反映了生物学的动态和活跃的发展 。 同时 , 科学文献中焦点的周期性变化和新领域和新技术的出现 , 吸引了哲学家的好奇心 , 并呼吁他们做出贡献 。 但“生态哲学”或“微生物学哲学”等所谓的子领域的身份并没有具体化 , 生物学哲学家也很少会自我限制在一个子领域 。 因此 , 这里不采用逐个字段的方法 。
第一部分提供了几个例子 , 说明生物学哲学家如何追寻生命科学某些特定领域的发展 。 在某些时候 , 这种追求可以导致生物学哲学本身的扩展 , 不仅包括新的科学知识 , 而且包括新的科学方法 。 此外 , 为了解决科学的新方面 , 即科学实践的各个方面 , 可能需要对哲学方法本身进行深入修改 。 这些例子涉及从微生物进化开始的基因交换的分子研究、生态建模的进展以及模式生物的构建和管理 。 近年来 , 一些哲学家开始对广泛存在于真菌、植物和动物中的各种基因交换机制的证据越来越感兴趣 , 而不仅仅是原核生物 。
哲学家们将这一证据与普遍生命之树的想法进行了对比 , 即有性繁殖、遗传隔离的物种通过遗传隔离繁殖 。 考虑到包括动物在内的各种生物体中存在大量的网状结构和横向基因转移 , 通用生命树的想法已经变得难以接受 。 奥马利提议放弃以动物为中心的进化哲学 。 它的主要原则是 BSC对于形成物种的生物是“普遍的” , 分叉的血统是祖先重建的全部 , 其余的生命更简单 , 更少多样化 , 并且在进化上不那么“真实” 。 这种以动物为中心的进化哲学的后果是 , 它最多可以包括一段被严重截断的进化事件历史 。
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